Документальных подтверждений происхождения названия Железного Порта нет. Существует несколько версий, основанных на рассказах местных жителей.Одна из версий гласит, что в селе был железный пирс, уходящий на 100 метров в море. Пирс использовался для погрузки на небольшие суда зерна и рыбы. В последствии, с постепенным наступлением моря на сушу, пирс оказался далеко от берега, и был поглощён морем.Согласно другой версии, для хранения зерна, предназначенного для отгрузки, использовался амбар с железной крышей, и моряки, видевшие амбар с судов, дали селу название.Наличие порта в ранней истории Железного Порта подтверждается и третьей версией. Однако, согласно ей, изначальное название села было украинским (Залізний Порт), и произошло от украинского глагола «заліз» (русск. залез): «І залізло це село під саме море. І тому порт - Залізний». Позже, после русификации названия, оно было переведено буквально.